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终于有一天，和他们相依为命的小狗死了，而后他们开始追寻木叶三忍。准备好能够长期携带的食物，将黄狗安葬后，三个孩子背着包裹，踏上了漫长的拜师之旅。在出发之前，弥彦把那些偷来的但又无法带走的食物，还给了那些被偷的村民。
可是，追寻木叶三忍绝不是简单的事情，这对三个孩子来说，就是不断地深入战场，不停地彷徨迷惘。有一次弥彦不知道从哪里找来了防毒面具，三个孩子戴着防毒面具，冒险进入了有毒的雾区。弥彦的谨慎小心，避过了陷阱，救了他们多次。虽然没有找到三忍，但弥彦捡回来一把苦无，拿在手里耍帅。
看到长门和小南有些消沉，弥彦不断地鼓舞，终于让二人露出笑容。如果没有弥彦，长门和小南恐怕早就放弃了。然而忍者是不会轻易留下自己的行动痕迹的，木叶三忍更加是难以找到。可是弥彦没有放弃，在他的坚持下，三个孩子更加地深入战场了。
弥彦认为，越是战斗激烈的战场，三忍活跃的可能性越高。有一次，三人经过峡谷，冒险攀上了一个高崖。弥彦把小南拉上来后，远处的爆炸声渐渐停息了，弥彦警觉这里的情况不对劲。弥漫天空的苦无、手里剑、起爆符像下雨一样落下来，三个孩子不凑巧地处在了战场的中心。
危急关头，长门打开了轮回眼，形成了一个斥力防护罩，挡住了所有的攻击。但是三人脚下的高崖却被起爆符炸毁了，三人向下坠落，掉入了峡谷的河流中。幸好三人出身雨之国，都熟悉水性，总算捡了条小命。命运之神开了个玩笑，弥彦三人挣扎上岸后，刚巧遇上了从这里经过的木叶三忍。他们终于找到了自来也，那位来自妙木山的蛤蟆仙人。
看见木叶三忍在那里休息，弥彦壮着胆子走过去，与自来也等人谈话。但是长门无法接受木叶忍者，原因是父母之死。在大雨中，三忍即将离去，弥彦提出了想要学习忍术，小南把纸花递给纲手。大蛇丸心性阴冷，“杀掉这些小鬼吧！我看过太多的战争孤儿，都非常凄惨……干脆在这里杀掉他们，也是为了这些孩子，对他们来说也是一种幸福……”
这种离谱的提议，自然被自来也和纲手否决。自来也让大蛇丸和纲手先回去，“我留下来暂时照顾一下这些孩子，起码等到他们能够自立为止。权当作对这个饱受战火国家的补偿。”
历尽艰辛长门、小南和弥彦终于和自来也相遇了，自来也决定留下来照顾他们。长门对木叶忍者芥蒂很深，但自来也给人的感觉与众不同。这样就开始了师徒4人的生活。
不久之后发生了一件事情。岩忍的余党来袭击了弥彦和长门，在弥彦即将被杀掉的瞬间，长门用轮回眼的力量杀掉了那个岩忍，而且是无意识的。随后，自来也和小南赶到这里，自来也发现长门有一种特殊的力量，那就是名为轮回眼的瞳术。这件事之后，本来一直疏于教导他们忍者修行的自来也，开始认真传授三人忍术。
虽然自来也说那是为了防身的忍术，但对长门来说，那是为了能让他控制轮回眼的力量。但长门害怕这种力量，仇恨在让力量失控。长门认为自己做错了事情，罪恶感一直责备着他。但是自来也从低谷中拯救了他，告诉他力量也许会伤害人，但也能拯救别人，弥彦就因此逃过一劫。“你保护了朋友，你做的应该是正确的事情。谁也没有权利来责备你……”等长门回过神来，他发现自己已经在不知不觉中认同了自来也老师。
自来也说，“受到伤害会记住仇恨，伤害了别人会遭到憎恨……但是当体会了这种痛楚之后，才能真正地善待他人。人们是在体会痛楚之后，才会成长的。成长之后要怎么做，这就要自己去考虑了。体会痛楚，不断地思考，得出怎样的答案……”自来也仿佛也是说给自己听一样，这样教导长门，但是他自己也没有找出答案。长门道，“就如同你现在一样，鸣人。”
当时长门觉得自己找到了答案，“我只要保护两个人，不管会伴随着怎样的痛苦。”自来也告诉长门，“这个忍者的世界充满了仇恨，战争和憎恨到处蔓延……我在想着如何消除它……和平究竟是什么，我想找到这个答案。”这之后过了3年，通过修行，3个孩子变成了少年，身心都有所成长。只是自来也的话一直留在长门心中翻滚，久久难以释怀。
自来也把这个答案寄托在了长门的轮回眼上，“很久以前，人们经常争斗，战争不断，是比现在更加惨烈的时代。那个时代出现了一个僧侣，首次阐明了查克拉的真理，想将世界引向和平。传说他走遍世界，传播忍术绝学，宣传自己的教义。忍术并非只包括武力，同时也是将人们引向和平的教诲。这位僧人就是六道仙人，是被冠以世界救世主的圣人，而他拥有的正是轮回眼。，这是六道仙人的格言。他坚信人们能够真正相互理解的世界，终将到来。”
自来也认为长门可能就是这位仙人的转世，轮回眼寄托着仙人的心愿。三年后，自来也将和平的信念托付给了长门后离开了。
把和平的希望寄托给了长门和弥彦，自来也就离开了他们。弥彦不负众望，成为了大家的首领，不久将其发展壮大，并当上了这个庞大的组织的领袖，不依赖权利和武力去创造和平的想法很快得到了大家的支持，许多忍者加入了进去。这个组织就叫做晓，很快就名声大振，大家都赞同构建一个不靠极端武力维持的和平世界。
但是，当时依然处于第二次忍界大战期间，岩隐、木叶、砂隐三大忍村还在交战中。雨隐的首领半藏，听闻了这个组织，故意接近了弥彦等人。因为半藏已经无法忽视弥彦等人的存在了。半藏提出以晓作为主体，向三大国提出和平交涉的提案。
为了达成这个和平协议，弥彦等人同意了半藏的建议，答应协助半藏实现雨之国的和平。但这一切不过是祸端的开始，弥彦等人在政治上还很幼稚。一切都是半藏的圈套和陷阱，他担心雨隐的主导权被弥彦夺走，为此处心积虑地要除去弥彦。
果然，在约好交涉的地点，包括木叶的暗部在内，半藏率精锐部下埋伏在那里。半藏和木叶暗部的首领团藏勾结，想要将晓全部抹杀。团藏为了争夺火影的宝座，答应协助半藏。半藏为了维护雨隐的统治，勾结了团藏。在长门眼里，这两个藏，就是狼狈为奸沆瀣一气。
半藏出其不意地抓住了小南，说出了自己的真实目的，以小南的性命为要挟，逼弥彦自杀。半藏掷下苦无，让长门用这把苦无杀死弥彦，“这样的话，我就放你和这个女人逃走。”小南大惊，“住手啊，长门。别管我，你们两个快掉逃走，回头再给我报仇！”
弥彦见情况危急，命令长门用苦无杀死自己，以便救出小南。看到长门犹豫不决，弥彦抓住长门的手臂，把苦无刺入自己的身体，自尽而亡。临终前，弥彦嘱咐长门，“你和小南要一起好好活下去！你也许真的是这个世界的救世主……一定可以的……”
弥彦就此死去，小南悲痛欲绝，长门陷入了痛苦中。半藏见目的达到，晓已经群龙无首，下达了总攻击的命令，“杀！”顷刻间，晓的成员伤亡惨重，长门用神罗天征弹开了雨忍的攻击，趁机接近了半藏，救出了小南。
然而，半藏已经在小南的所在位置，布置了大量的起爆符，长门中了陷阱，被起爆符缠住了双腿。爆炸中，长门的双腿被炸成重伤，从此不良于行。半藏冲过来，以火遁攻击，长门用饿鬼道的技能吸收了这个忍术。看到长门的眼睛，半藏大吃一惊，“真不赖啊，小子！竟然能够吸收我的火遁忍术，并且逃出了起爆符陷阱！”长门道，“小南，抱住弥彦，静静地躺着……”
木叶的暗部和雨忍们一拥而上，长门发动通灵术，召唤来外道魔像，地狱的冥王，把那些敌人杀得落花流水。半藏也是第一次看到这样的通灵兽，大为震惊。召唤完之后长门背部就被插上了黑色铁棒，而且身体变得骨瘦如柴。
长门以此控制外道魔像，从冥王嘴里放出了一条查克拉巨龙，大肆屠杀雨忍和木叶暗部。半藏很快发现，只要人接触那个查克拉巨龙，灵魂就会被吸走。部下们伤亡殆尽，半藏这才意识到晓的真正核心战力是长门，而不是首领弥彦。真正让半藏震惊的是长门的轮回眼。
长门控制巨龙，直接攻袭半藏。半藏发动了瞬身之术，险险逃过了一劫，所在位置被查克拉巨龙凿穿大坑。
雨隐的首领却利用卑鄙的手段杀害了弥彦。弥彦死去之后，长门就代替弥彦，成为了晓的首领。为了他们的目标，组织的成员接二连三的死去了。长门认为只要人存在，憎恨是不会消除的，自来也的想法根本就不切实际。
明明有所成长，可是跟之前没有任何变化。尽管拥有强大的忍术，可依旧不能保护同伴。同伴的死去，不管是身体上还是心理上都对长门造成很大的伤害，“我错了，我注意到我得出的答案，简直狗屁不如。弥彦是我的救命恩人，也是我的梦想，想要拼上性命守护的无可替代的朋友。弥彦的死，就是我第二个最大的痛楚。”失去双亲和挚友，痛苦充满了长门的心胸，化身为佩恩的人生从此开始了。
长门接替了弥彦成为晓的首领，之后又有许多同伴在战斗中死去。长门语气偏激，“很多很多，不断有人死去……沉溺于和平幻觉之中，你们的火之国民众都是些虚伪的和平主义者。给予木叶村每笔的委托金，都成为了战争资金。火之国的民众明知助长了不少战争的事实，却口口声声地说着伪善的和平。你们大国的和平，不过是建立在我们小国牺牲基础上的。你们的和平是对我们的暴力！人只要活着，就会在不经意之间伤害他人。只要人类还存在，仇恨也将与之共存。在这诅咒的世界里，根本不存在真正的和平！自来也老师所说的话，全部都是不切实际的。”
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木叶，奈良鹿久、山中亥一、秋道丁座三人在一起聚餐，亥一道，“说起来，我们三人这样齐聚一堂，也是很久之前的事情了吧！”丁座不停地往嘴里塞饭，“说起来就是啊！”鹿久道，“大蛇丸的木叶崩溃计划之后，这还是第一次啊！”亥一有些感怀，“并称为猪鹿蝶，被其他国家畏惧，也是过去的事情了。”丁座晃动手里的空碗，“我们还没退役呢！”鹿久道，“好久没做了，试试那个吧！”丁座说好，鹿久大喊，“那就开始吧！”三人摆出姿势，“无敌阵型，猪鹿蝶！”“太帅了！”“是啊，不管多大年纪，同伴都是好东西啊！”井野从窗户外看到，嘲讽三人，“真是的，都一把年纪了，还在那里卖萌！”
三人重新坐下来，鹿久疑惑，“说起来，我们今天好像还约了别人吧！昨天久违的见了面……”亥一也道，“对啊，想偶尔也一起吃一顿饭……”丁座道，“是谁来着？想不起来了……”油女志微就坐在隔壁，“喂喂，居然会忘记同伴，这可是老年痴呆症的征兆啊！”服务生过来，“客人，请问你要点什么呢？”志微语气不怒自威，“我应该在2个小时之前就已经点过了。”老板擦汗，急忙跑过来道歉，然后带着服务生跑开，去查看这个客人到底点了什么。油女志乃亲眼看到了这一幕，“原来我的不引人注意，是遗传啊！”